Никита Саввич родился в Красноуфимском округе, Пермского наместничества, 19 января 1763 году в семье ротного писаря Саввы из духовного сословия. Брат Иоанн Попов в будущем станет дьячком.
В начале 1777 года поступил в Вятскую Духовную Семинарию.
15 ноября 1783 года перешел в учительскую семинарию Янковича де Мириево позже ставшим педагогическим институтом, где занимался у профессоров Головина, Зуева, Гакмана, Сырейщикова.
Посещал публичные лекции при Академии наук академика Озерецковского, Котельникова и Соколова. 20 августа 1786 года окончил семинарию.
22 сентября 1786 года вместе с тремя студентами был определён графом П. В. Завадовским, председателем комиссии об учреждении училищ, в качестве старшего учителя естественной истории, географии и всеобщей истории Главного народного училища преобразованного из городской народной школы, основанной в 1783 году, расположенного в городе Перми.
